MÉTODO DE PROSPECÇÃO DE GENOMA, BASEADO EM MAPA PARA IDENTIFICAÇÃO DE LOCI REGULADORES QUE CONTROLAM O NÍVEL DE TRANSCRITOS E PRODUTOS DE GENES

IPC Classification

Priority claims

Abstract

"MÉTODO DE PROSPECÇÃO DE GENOMA, BASEADO EM MAPA PARA IDENTIFICAÇÃO DE LOCOS REGULADORES QUE CONTROLAM O NÍVEL DE TRANSCRITOS E PRODUTOS DE GENES". A invenção concerne um método para identificação de uma ou mais regiões dentro de um genoma de um organismo de interesse, que faz a mediação da expressão de um ou mais genes de interesse. O método compreende a identificação de um primeiro e um segundo organismos de interesse, o primeiro organismo de interesse sendo caracterizado por exibir uma resposta mensurável para um estímulo ambiental ou ainda por exibir um fenótipo associado com a expressão de gene diferencial associada com um processo de interesse. O segundo organismo de interesse é caracterizado por omitir ou não exibir uma resposta forte ao estímulo, como a observada dentro do primeiro organismo de interesse ou por exibir um diferente fenótipo comparado com o do primeiro organismo de interesse, em que o diferente fenótipo é associado com o processo de interesse, ou exibir um fenótipo de interesse que é segregado quando comparado com o primeiro organismo de interesse ou uma combinação dos mesmos. Os primeiro e segundo organismos de interesse são cruzados para produzir uma população de progênie segregada e o RNA é extraído de cada progênie segregada. O nível de expressão de gene de um ou mais genes de interesse que se encontram associados à resposta ao estímulo ambiental ou ao processo de interesse é quantificado. É preparado um mapa de ligação da progênie segregada, usando um ou mais marcadores e a relação entre o dito um ou mais marcadores no mapa de ligação e a expressão do gene do dito um ou mais genes de interesse é determinada e um ou mais locos de característica quantitativa (QTL) identificado. O presente método também concerne à identificação de um ou mais QTLs associados com um ou mais genes de interesse na progênie segregada, que é submetido a um desejado estímulo ambiental. Além disso, o presente método pode ser usado para identificação de um ou mais QTLs correspondentes a um fator de transcrição ou a qualquer fator que controle a expressão de um ou mais genes de interesse e o dito um ou mais genes localizados no dito um ou mais QTLs pode ser isolado e caracterizado.