VOXELIZAÇÃO DE PROTEÍNA DE MÚLTIPLOS CANAIS PARA PREDIZER A PATOGENICIDADE VARIANTE COM O USO DE REDES NEURAIS CONVOLUCIONAIS PROFUNDAS

IPC Classification

Priority claims

Abstract

Trata-se de um sistema que inclui pelo menos um voxelizador, um codificador de alelo alternativo, um codificador de conservação evolucionária e uma rede neural convolucional. O voxelizador acessa uma estrutura tridimensional de uma sequência de aminoácidos de referência de uma proteína e encaixa uma grade tridimensional de voxels em átomos na estrutura tridimensional por aminoácidos para gerar canais de distância em aminoácidos. O codificador de alelo alternativo codifica uma sequência de alelos alternativa para cada voxel na grade tridimensional de voxels. O codificador de conservação evolucionária codifica uma sequência de conservação evolucionária para cada voxel na grade tridimensional de voxels. A rede neural convolucional aplica convoluções tridimensionais a um tensor que inclui os canais de distância em aminoácidos codificados com a sequência de alelos alternativa e as respectivas sequências de conservação evolucionárias, e determina uma patogenicidade de um nucleotídeo variante com base, pelo menos em parte, no tensor.