MÉTODO PARA DETERMINAR OS VALORES DE COR CORRIGIDOS, E, SEQUENCIADOR DE ÁCIDOS NUCLEICOS

IPC Classification

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Abstract

Métodos eficientes de memória determinam valores de cor corrigidos de dados de imagem adquiridos por um sequenciador de ácidos nucleicos durante um ciclo de chamada de bases. Tais métodos podem: (a) obter uma imagem de um substrato (por exemplo, de uma porção de uma célula de fluxo) incluindo uma pluralidade de sítios onde as bases de ácido nucleico são lidas; (b) medir valores de cor da pluralidade de sítios a partir da imagem do substrato; (c) armazenar os valores de cor em um buffer do processador do um ou mais processadores do sequenciador; (d) recuperar valores de cor parcialmente corrigidos na fase da pluralidade de sítios, onde os valores de cor parcialmente corrigidos na fase foram armazenados na memória do sequenciador durante um ciclo de chamada de bases imediatamente anterior; (e) determinar uma correção pré-faseamento; e (f) determinar os valores de cor corrigidos. Em várias implementações, essas operações são todas realizadas durante um único ciclo de chamada de bases. Em certas modalidades, os métodos adicionalmente incluem o uso dos valores de cor corrigidos para fazer chamadas de base para a pluralidade de sítios. Sequenciadores podem ser concebidos ou configurados para implementar tais métodos.