MÉTODO E SISTEMA PARA REALINHAMENTO DE LEITURA DE DADOS DE SEQUENCIAMENTO

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Abstract

A presente invenção refere-se a realinhamento de leitura de dados de sequenciamento. Um método obtém a partir de um conjunto de dados de alinhamento de sequência um alinhamento inicial de uma sequência de leitura para uma sequência de referência e executa o processamento de realinhamento no alinhamento inicial. O processamento de realinhamento inclui a identificação de indel (s) candidato que incluem zero ou mais indels na leitura alinhada e zero ou mais indels alinhados próximos à leitura alinhada, conforme indicado pelo conjunto de dados de alinhamento da sequência, criando uma leitura alinhada achatada baseada na remoção da leitura alinhado de qualquer indel indicado pelo alinhamento inicial e determinar o realinhamento candidato da sequência de leitura com a sequência de referência com base na introdução, para cada realinhamento candidato do realinhamento (s) candidato, pelo menos um indel candidato do indels (s) candidato na leitura alinhada achatada. O método fornece ainda o alinhamento inicial ou um realinhamento candidato selecionado do realinhamento (s) candidato com base nos critérios de seleção.