MÉTODO E APARELHO PARA O ACESSO AOS DADOS BIOINFORMÁTICOS ESTRUTURADOS NAS UNIDADES DE ACESSO

IPC Classification

Priority claims

Abstract

Método e aparelho para codificação e acesso seletivo de dados de sequência genômica comprimida produzidos por máquinas de seqüenciamento genômico. O processo de codificação baseia-se no alinhamento de leituras de sequências em relação a sequências de referência preexistentes ou construções, na classificação e codificação das leituras de sequências por meio de conjuntos de descritores e particionamento adicional dos conjuntos de descritores em unidades de acesso de diferentes tipos. O acesso seletivo eficiente a regiões genômicas específicas com a garantia de recuperar todas as leituras de sequência mapeadas para essas regiões é fornecido por: sinalizar o tipo de configuração de mapeamento de dados usado para armazenar ou transmitir os conjuntos de descritores, determinar o número mínimo de unidades de acesso que precisam ser recuperadas e decodificadoas para acessar uma região genômica, fornecendo uma tabela de índice principal que contém todas as informações para otimizar o processo de acesso de dados.