MÉTODO E SISTEMAS PARA A REPRESENTAÇÃO E PROCESSAMENTO DE DADOS DE BIOINFORMÁTICA UTILIZANDO SEQUÊNCIAS DE REFERÊNCIA

IPC Classification

Priority claims

Abstract

Método e aparelho para a representação e processamento de dados de sequência genômica, produzidas por máquinas de sequenciamento genômico, quando alinhadas em uma ou mais sequências de referência. As leituras de sequência são codificadas alinhando-as em relação a sequências de referência pré-existentes ou construídas. Após o alinhamento, o processo de codificação é composto de uma classificação das leituras em classes de dados, seguida da codificação de cada classe de dados em termos de uma multiplicidade de camadas de descritores. Modelos específicos de fontes e codificadores de entropia são usados para codificar os subconjuntos de descritores usados para representar cada classe de dados.