PLATAFORMA DE ANÁLISE GENÔMICA PARA EXECUTAR UMA SEGMENTAÇÃO DE ANÁLISE DE SEQUÊNCIA

IPC Classification

Priority claims

Abstract

Trata-se de um sistema, método e aparelho para executar uma análise de bioinformática sobre dados de sequência genética. Particularmente, é fornecida uma plataforma de análise genômica para executar uma segmentação de análise de sequência. A plataforma de análise genômica inclui um ou mais de um primeiro circuito integrado, em que cada primeiro circuito integrado forma uma unidade de processamento central (CPU) que responde a um ou mais algoritmos de software que são configurados para instruir a CPU a realizar um primeiro conjunto de etapas de processamento genômico da segmentação de análise de sequência. Adicionalmente, um segundo circuito integrado também é fornecido, sendo que cada segundo circuito integrado forma um arranjo de portas programável em campo (FPGA), em que o FPGA é configurado por firmware para dispor um conjunto de circuitos lógicos digitais com fio que são interconectados por uma pluralidade de interconexões físicas para realizar um segundo conjunto de etapas de processamento genômico da segmentação de análise de sequência, sendo que o conjunto de circuitos lógicos digitais com fio de cada FPGA é disposto como um conjunto de mecanismos de processamento para realizar o segundo conjunto de etapas de processamento genômico. Uma memória compartilhada também é fornecida.