Resumo técnico
MÃTODO PARA DETECTAR A PRESENÃA DE PELO MENOS UMA SEQUÃNCIA DE NUCLEOTÃDEOS DE INTERESSE EM UMA AMOSTRA, KIT, MÃTODO PARA DETECTAR A PRESENÃA DE UM ALVO DE INTERESSE EM UMA AMOSTRA E MÃTODO PARA REDUZIR LIGAÃÃO NÃO ESPECÃFICA DE CÃLULAS, ORGANELAS SUBCELULARES, BIOMOLÃCULAS, OU MOLÃCULAS QUÃMICAS. A presente invenção refere-se a métodos para a determinação e detecção de sequências de ácidos nucleicos em uma amostra. O ácido nucleico pode ser RNA ou DNA ou ambos. A invenção também se refere a métodos para a determinação da presença e espécies de vários micro-organismos em uma amostra. Também foi identificado um conjunto de sequências de oligonucleotÃdeo ácido nucleicos dentro dos rRNAs de organismos Gram-negativos que facilita tanto a identificação ampla de organismos Gram-negativos como uma classe quando usados como uma reunião ou em combinação, por exemplo, em um ensaio de hibridização. Esse conjunto de oligonucleotÃdeos pode detectar sequências que são indicativas da presença de organismo da classe ampla de organismos Gram-negativos, enquanto exibem pouco ou nenhuma identificação falsa de organismos Gram-positivos, e fungos, ou outros micro-organismos. O ensaio inclui incubação concorrente com pelo menos uma sequência de nucleotÃdeos de interesse, pelo menos uma sonda de ácido nucleico, um fluortensoativo, e uma nuclease. O ensaio pode ser ainda empregado para detectar a presença de bactérias, fungos, ou outros micro-organismos pelo uso de sondas especÃficas adicionais, ou para detectar e/ou identificar sequências de ácidos nucleicos-alvo em uma amostra. Ainda, a presente invenção refere-se-se também a métodos para reduzir ligação não especÃfica e facilita a formação de complexo em ensaio de ligação. O ensaio de ligação pode ser, mas sem limitação, um ensaio de hibridização de ácido nucleico ou um imunoensaio. A presente invenção refere-se também a métodos de detecção que empregam pelo menos um-alvo de interesse, que pode ser uma sequência de nucleotÃdeos, pelo menos uma sonda, que pode ser uma sonda de ácido nucleico e uma nuclease.