IDENTIFICAÇÃO DE ALVOS TERAPÊUTICOS PARA DESENHO COMPUTACIONAL DE DROGAS CONTRA BACTÉRIAS DOTADAS DA PROTEÍNA PILT

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Abstract

IDENTIFICAÇÃO DE ALVOS TERAPÊUTICOS PARA DESENHO COMPUTACIONAL DE DROGAS CONTRA BACTÉRIAS DOTADAS DA PROTEÍNA PILT. A presente invenção se refere a um método para identificar regiões alvo existentes na interface de monômeros constituintes da proteína PilT com o objetivo de desenhar moléculas potencialmente aplicáveis no comprometimento da atividade desta proteína, controlando, assim, processos infecciosos. O método é caracterizado pela (i) seleção de pelo menos uma sequência de aminoácidos constituidora de monômero de PilT; (ii) desenvolvimento de um modelo computacional tridimensional da estrutura homo-hexamérica de PilT; (iii) análise computacional para determinar os resíduos de aminoácidos formadores de interface (IFR) e suas características fisico-químicas e estruturais para todas as cadeias dos modelos de complexos hexaméricos gerados; (iv) seleção das regiões a serem usadas corno alvos terapêuticos (e alvos terapêuticos preferenciais) na interface entre os monômeros baseada na intensidade de determinados parâmetros; (v) modelagem computacional para o desenho de moléculas potencialmente capazes de efetuar ligações e/ou interações entre regiões alvo dos monômeros. Notadamente, algumas das principais aplicações desta tecnologia consistem no combate à bactéria Xylella fastidiosa, agente etiológico da Clorose Variegada dos Citrus (CVC ou Amarelinho), e a doença de Pierce.