MÉTODOS PARA IDENTIFICAR IMPUREZAS DE PROTEÍNA DE CÉLULA HOSPEDEIRA E PEPTÍDEOS OU PROTEÍNAS DE VARIANTES DE SEQUÊNCIA

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Abstract

MÉTODOS PARA IDENTIFICAR IMPUREZAS DE PROTEÍNA DE CÉLULA HOSPEDEIRA E PEPTÍDEOS OU PROTEÍNAS DE VARIANTES DE SEQUÊNCIA. A presente invenção fornece métodos e sistemas para identificar impurezas de proteína da célula hospedeira (HCP) em uma amostra contendo proteínas de alta abundância. As impurezas de HCP podem ser enriquecidas usando ligandos peptídicos interagentes que foram fixados ao suporte sólido. As impurezas de HCP podem ser eluídas a partir do suporte sólido. As impurezas de HCP isoladas podem ser submetidas a digestão limitada para gerar componentes das impurezas HCP isoladas que podem subsequentemente ser identificadas usando um espectrômetro de massa. A presente invenção também fornece métodos e sistemas para identificar peptídeos ou proteínas de variantes de sequência (SV) em uma amostra contendo proteínas de alta abundância. Os peptídeos ou proteínas de SV podem ser enriquecidos usando ligandos peptídicos de interação que foram fixados a suporte sólido. Os peptídeos ou proteínas de SV podem ser eluídos a partir do suporte sólido. Os peptídeos ou proteínas de SV isolados podem ser submetidos a digestão completa ou limitada para gerar componentes dos peptídeos ou proteínas de SV isolados que podem ser subsequentemente identificados usando um espectrômetro de massa.