MÉTODO IMPLEMENTADO POR COMPUTADOR PARA FORNECER CONJUNTO DE DADOS DE SEQUÊNCIA DE ÁCIDO NUCLEICO PARA PROJETO DE OLIGONUCLEOTÍDEO

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Abstract

MÉTODO IMPLEMENTADO POR COMPUTADOR PARA FORNECER CONJUNTO DE DADOS DE SEQUÊNCIA DE ÁCIDO NUCLEICO PARA PROJETO DE OLIGONUCLEOTÍDEO. A presente invenção refere-se a um método implementado por computador para fornecer um conjunto de dados de sequência de ácido nucleico para o projeto de um oligonucleotídeo usado para detectar uma molécula de ácido nucleico alvo de um organismo de interesse. Na presente invenção, os dados da sequência de ácido nucleico recuperados por sinônimos para uma molécula de ácido nucleico alvo são classificados de acordo com o nome taxonômico e/ou identificação taxonômica (ID); sequências representativas taxonômicas são selecionadas entre dados de sequência de ácido nucleico com o mesmo nome taxonômico e/ou ID taxonômico; e as sequências representativas taxonômicas selecionadas são agrupadas de acordo com a homologia para selecionar uma sequência representativa de grupo em cada grupo; e então os dados da sequência de ácido nucleico tendo uma homologia de um valor predeterminado ou mais com a sequência representativa de grupo são fornecidos. Como resultado, foi confirmado que múltiplas sequências de ácido nucleico alvo para a molécula de ácido nucleico alvo foram recuperadas sem omissão e os resultados do alinhamento das múltiplas sequências de ácido nucleico alvo recuperadas foram adequadamente formados para serem referidos no projeto de oligonucleotídeos.