MÉTODO E SISTEMA PARA IDENTIFICAR E VALIDAR ANTÍGENOS CANDIDATOS COMPARTILHADOS E PARES DE LINFÓCITOS T ESPECÍFICOS DE ANTÍGENO COMPARTILHADOS

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Abstract

MÉTODO E SISTEMA PARA IDENTIFICAR E VALIDAR ANTÍGENOS CANDIDATOS COMPARTILHADOS E PARES DE LINFÓCITOS T ESPECÍFICOS DE ANTÍGENO COMPARTILHADOS. A presente invenção refere-se a um método e sistema para identificar e validar pares de antígenos candidatos e seus linfócitos T específicos de antígenos cognatos que são úteis para validar a atividade imunogênica de antígenos pareados e sequências de TCR. O método inclui, inter alia, etapas de determinação de uma ou mais variantes de splice que são mais altamente transcritas em uma amostra obtida de coorte de pacientes em comparação com uma amostra de referência, determinação de uma ou mais sequências de aminoácidos que ocorrem em uma tradução de aminoácidos da dita uma ou mais variantes de splice, mas não na variante de splice correspondente na amostra de referência, e previsão da ligação de HLA das sequências de aminoácidos para identificar o antígeno compartilhado candidato. A presente invenção também se refere a métodos de caracterização e/ou tratamento de uma condição médica, incluindo câncer.