SISTEMA À BASE DE ÁCIDO NUCLEICO PARA PROPAGAR INFORMAÇÕES E MÉTODO PARA MELHORAR SISTEMA DE COMPUTAÇÃO MOLECULAR À BASE DE ÁCIDO NUCLEICO

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Abstract

SISTEMA À BASE DE ÁCIDO NUCLEICO PARA PROPAGAR INFORMAÇÕES E MÉTODO PARA MELHORAR SISTEMA DE COMPUTAÇÃO MOLECULAR À BASE DE ÁCIDO NUCLEICO. Um método para melhorar um sistema de computação molecular à base de ácido nucleico inclui (A) identificar um sistema de computação composto de (i) uma estrutura de ácido nucleico que inclui um domínio duplex incompletamente emparelhado por base, (ii) pelo menos uma molécula de deslocamento de polinucleotídeo que pode ligar com a estrutura de ácido nucleico em condições de hibridização, de modo que a estrutura de ácido nucleico sofra uma transição no estado de energia devido a uma reação de migração de ramo envolvendo o domínio duplex, e (iii) uma molécula de polinucleotido de choque que compete com a molécula de deslocamento de polinucleotido para ligação com a estrutura de ácido nucleico em condições de hibridização, mas não pode produzir uma reação de migração de ramo envolvendo o domínio duplex; então (B) reconfigurar pelo menos uma da molécula de deslocamento e da estrutura de ácido nucleico, respectivamente, para incorporar uma modificação química relativa a uma primeira molécula de referência que compreende nucleosídeos naturais e tem o mesmo conteúdo de sequência que a molécula de deslocamento ou a estrutura de ácido nucleico, conforme seja o caso, em que a modificação faz que a ligação da molécula de deslocamento e da estrutura de ácido nucleico tenham uma energia livre de hibridização diferindo daquela de uma primeira ligação de referência entre a molécula de deslocamento ou a estrutura de ácido nucleico e a primeira molécula de referência, de modo que a reação de migração de ramo é facilitada em relação à primeira ligação de referência; e/ou (C) reconfigurar pelo menos uma da molécula de choque e da estrutura de ácido nucleico, respectivamente, para incorporar uma modificação química em relação a uma segunda molécula de referência que compreende nucleosídeos naturais e tem o mesmo conteúdo de sequência que a molécula de choque ou a estrutura de ácido nucleico, conforme seja o caso. A modificação efetuada via tal reconfiguração faz que a ligação da referida molécula de choque e da referida estrutura de ácido nucleico de uma segunda de referência entre a molécula de choque ou a estrutura de ácido nucleico e a segunda molécula de referência, de tal modo que a ligação da molécula de choque seja impedida em relação à segunda ligação de referência.