MÉTODO DE AQUISIÇÃO DE PROTEÍNAS COM ALTA AFINIDADE POR UM DESENHO AUXILIADO POR COMPUTADOR

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Abstract

MÃTODO DE AQUISIÃÃO DE PROTEÃNAS COM ALTA AFINIDADE POR UM DESENHO AUXILIADO POR COMPUTADOR A presente invenção fornece um método de adquirir proteínas com alta afinidade através de design auxiliado por computador (CAD), que compreende os passos de: 1) baseado em uma estrutura conhecida de cocristal de um complexo de uma proteína e uma molécula-alvo, determinar os locais candidatos de mutação da proteína; 2) simular mutações de aminoácidos em Iocais candidatos da proteína um por um através de computador, de forma a adquirir estruturas otimizadas; 3) procurar conformações das estruturas otimizadas adquiridas no passo 2) através de computador; 4) analisar as energias totais e os desvios da média quadrática das conformações adquiridas no passo 3) e, então, selecionar conformações com energia minimizada e menos desvios de média quadrática para analisar energias de ligação ligando à mdécula-alvo e para adquirir estruturas simulativas; e 5) baseado nas estruturas simulativas adquiridas no passo 4), prever e validar proteínas mutantes com alta afinidade.